Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Urb2E9Q7L1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Urb2E9Q7L1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Urb2E9Q7L1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Urb2E9Q7L1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Urb2E9Q7L1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Urb2E9Q7L1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Urb2E9Q7L1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Urb2E9Q7L1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Urb2E9Q7L1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Urb2E9Q7L1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Urb2E9Q7L1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Urb2E9Q7L1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Urb2E9Q7L1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms