Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4X4

Vmn2r11, Vomeronasal 2, receptor 11, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r11E9Q4X4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r11E9Q4X4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r11E9Q4X4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r11E9Q4X4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r11E9Q4X4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r11E9Q4X4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn2r11E9Q4X4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms