Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30bE9PVL6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30bE9PVL6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30bE9PVL6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms