Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrt2E9PUL5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrt2E9PUL5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms