Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Soga1E1U8D0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Soga1E1U8D0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Soga1E1U8D0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Soga1E1U8D0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Soga1E1U8D0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms