Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
4930407I10RikD3Z5T8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
4930407I10RikD3Z5T8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
4930407I10RikD3Z5T8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
4930407I10RikD3Z5T8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
4930407I10RikD3Z5T8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
4930407I10RikD3Z5T8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
4930407I10RikD3Z5T8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
4930407I10RikD3Z5T8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC32■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms