Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc8D3YZV8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc8D3YZV8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc8D3YZV8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms