Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SafbD3YXK2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SafbD3YXK2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SafbD3YXK2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SafbD3YXK2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms