Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17333C6EQI3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17333C6EQI3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm17333C6EQI3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms