Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptprz1B9EKR1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptprz1B9EKR1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms