Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp42B2RQC2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp42B2RQC2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp42B2RQC2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp42B2RQC2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms