Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H60cB1B213 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H60cB1B213 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H60cB1B213 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H60cB1B213 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H60cB1B213 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
H60cB1B213 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
H60cB1B213 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H60cB1B213 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H60cB1B213 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H60cB1B213 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H60cB1B213 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H60cB1B213 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms