Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Scn7aB1AYL1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Scn7aB1AYL1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scn7aB1AYL1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms