Protein–RNA interactions for Protein: B1AXH1

Nhsl2, NHS-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl2B1AXH1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl2B1AXH1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl2B1AXH1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl2B1AXH1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl2B1AXH1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl2B1AXH1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl2B1AXH1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nhsl2B1AXH1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nhsl2B1AXH1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nhsl2B1AXH1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhsl2B1AXH1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhsl2B1AXH1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhsl2B1AXH1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms