Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prr29B1ARI9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Prr29B1ARI9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prr29B1ARI9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 407.3 ms