Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc4a11A2AJN7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc4a11A2AJN7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc4a11A2AJN7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc4a11A2AJN7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc4a11A2AJN7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc4a11A2AJN7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a11A2AJN7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a11A2AJN7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a11A2AJN7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a11A2AJN7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc4a11A2AJN7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc4a11A2AJN7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms