Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd7A2AJK6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd7A2AJK6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd7A2AJK6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd7A2AJK6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms