Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc183A2AJB1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc183A2AJB1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc183A2AJB1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms