Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VirmaA2AIV2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VirmaA2AIV2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VirmaA2AIV2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VirmaA2AIV2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms