Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc163A2AGD7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc163A2AGD7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc163A2AGD7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms