Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930447F04RikA2AFR2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms