Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms