Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ino80eA0A0U1RP99 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ino80eA0A0U1RP99 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms