Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trbv23A0A0A6YWQ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trbv23A0A0A6YWQ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms