Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl27Q99N92 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl27Q99N92 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl27Q99N92 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl27Q99N92 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl27Q99N92 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl27Q99N92 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl27Q99N92 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl27Q99N92 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl27Q99N92 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms