Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4933424G06RikA0A140LIP3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms