Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms