Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933424G06RikA0A140LIP3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms