Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf728Q6P5C7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Znf728Q6P5C7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Znf728Q6P5C7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Znf728Q6P5C7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Znf728Q6P5C7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Znf728Q6P5C7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Znf728Q6P5C7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Znf728Q6P5C7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Znf728Q6P5C7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Znf728Q6P5C7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf728Q6P5C7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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