Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms