Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms