Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Mbd3Q9Z2D8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms