Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C8

Ybx2, Y-box-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx2Q9Z2C8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ybx2Q9Z2C8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ybx2Q9Z2C8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms