Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L4

Rs1, Retinoschisin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rs1Q9Z1L4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rs1Q9Z1L4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rs1Q9Z1L4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rs1Q9Z1L4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rs1Q9Z1L4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rs1Q9Z1L4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rs1Q9Z1L4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rs1Q9Z1L4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms