Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nme4Q9WV84 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme4Q9WV84 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nme4Q9WV84 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme4Q9WV84 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme4Q9WV84 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme4Q9WV84 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme4Q9WV84 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme4Q9WV84 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme4Q9WV84 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme4Q9WV84 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme4Q9WV84 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme4Q9WV84 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms