Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUN8

Lbx2, Transcription factor LBX2, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx2Q9WUN8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx2Q9WUN8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lbx2Q9WUN8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lbx2Q9WUN8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lbx2Q9WUN8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms