Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn7Q9R1S8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn7Q9R1S8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Capn7Q9R1S8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn7Q9R1S8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms