Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M4

Podxl, Podocalyxin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PodxlQ9R0M4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PodxlQ9R0M4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PodxlQ9R0M4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PodxlQ9R0M4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PodxlQ9R0M4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PodxlQ9R0M4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PodxlQ9R0M4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PodxlQ9R0M4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PodxlQ9R0M4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PodxlQ9R0M4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PodxlQ9R0M4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PodxlQ9R0M4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms