Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tk2Q9R088 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tk2Q9R088 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tk2Q9R088 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tk2Q9R088 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tk2Q9R088 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tk2Q9R088 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tk2Q9R088 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tk2Q9R088 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tk2Q9R088 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tk2Q9R088 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tk2Q9R088 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tk2Q9R088 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms