Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb1bp2Q9R000 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Itgb1bp2Q9R000 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb1bp2Q9R000 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms