Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VapbQ9QY76 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VapbQ9QY76 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VapbQ9QY76 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VapbQ9QY76 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms