Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr2e3Q9QXZ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr2e3Q9QXZ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms