Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nufip1Q9QXX8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nufip1Q9QXX8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nufip1Q9QXX8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nufip1Q9QXX8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms