Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx8Q9QXV1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cbx8Q9QXV1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms