Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad18Q9QXK2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rad18Q9QXK2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad18Q9QXK2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms