Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm4Q9QXA5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lsm4Q9QXA5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lsm4Q9QXA5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms