Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slamf1Q9QUM4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slamf1Q9QUM4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slamf1Q9QUM4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms