Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUJ7

Acsl4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl4Q9QUJ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsl4Q9QUJ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl4Q9QUJ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Acsl4Q9QUJ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acsl4Q9QUJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acsl4Q9QUJ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Acsl4Q9QUJ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Acsl4Q9QUJ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acsl4Q9QUJ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsl4Q9QUJ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsl4Q9QUJ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsl4Q9QUJ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsl4Q9QUJ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsl4Q9QUJ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsl4Q9QUJ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms