Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc2lQ9JME7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc2lQ9JME7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms