Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaja4Q9JMC3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaja4Q9JMC3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnaja4Q9JMC3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnaja4Q9JMC3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaja4Q9JMC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaja4Q9JMC3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaja4Q9JMC3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaja4Q9JMC3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaja4Q9JMC3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms